Οι προπτυχιακές και μεταπτυχιακές υποτροφίες αποτελούν αποκούμπι πολλών αδύνατων οικονομικά φοιτητών ιδίως τη σημερινή δύσκολη οικονομικά συγκυρία. Οι υποτροφίες αυτές μπορούν να δίνονται είτε μέσω διαγωνισμού ή με μια σειρά μοριοδοτούμενων κριτηρίων όπως η καταγωγή του υποψηφίου ή οικονομική του κατάσταση. Το Πανεπιστήμιο Αθηνών διαχειρίζεται διάφορα Κληροδοτήματα ειδικού σκοπού που χορηγούν υποτροφίες και βραβεία.